（通訊員 謝勝鬆）近日，我院動物遺傳(chuan) 育種團隊在Nature子刊《Nature Communications》雜誌上在線發表了題為(wei) “CRISPR screening of porcine sgRNA library identifies host factors associated with Japanese encephalitis virus replication”的研究成果。該研究首次構建了基於(yu) 豬全基因組CRISPR/Cas9敲除文庫技術的高通量功能基因篩選平台，並運用該技術篩選和鑒定出參與(yu) 乙型腦炎病毒複製的必需宿主基因。這一研究對豬抗病育種及具有育種價(jia) 值的關(guan) 鍵功能基因發掘具有重要參考價(jia) 值。

隨著家豬基因組測序技術日趨完善，以及全基因組選擇在豬育種中逐步應用，家豬基因組學的研究快速進入功能基因組時代。借助CRISPR/Cas9基因編輯技術，國內(nei) 外已經構建出多種基因編輯豬模型。然而，具有重大育種價(jia) 值的可編輯基因和靶點仍然缺乏，製約了豬基因編輯育種研究工作進程，基因編輯技術的發展為(wei) 從(cong) 全基因組水平篩選重要功能基因提供了契機。基於(yu) 此，以家豬為(wei) 對象，該研究團隊利用自主開發的sgRNA文庫設計軟件，針對豬的幾乎全部蛋白編碼基因，長鏈非編碼RNA和微小RNA，設計和構建了一個(ge) 高質量sgRNA表達載體(ti) 文庫與(yu) 突變細胞文庫（PigGeCKO, v1.0，圖1）。隨後，該研究團隊利用豬的全基因組CRISPR敲除文庫技術，成功實現了高通量篩選和鑒定參與(yu) 乙型腦炎病毒複製的關(guan) 鍵宿主因子。

圖1.豬全基因組CRISPR敲除文庫（PigGeCKO）設計和構建

基於(yu) 全基因組CRISPR文庫設計構建關(guan) 鍵功能基因高通量篩選平台，對於(yu) 功能基因組研究和品種改良具有重要產(chan) 業(ye) 價(jia) 值，將大力推動家豬功能基因鑒定進入精準、高通量研究的新階段，為(wei) 基因功能鑒定和育種提供新思路和新策略。近年來，該團隊在sgRNA設計軟件開發（biootools.com）、高效準確評估sgRNA活性與(yu) 脫靶效應、基於(yu) CRISPR篩選文庫的功能基因挖掘及基因編輯豬育種新材料創製等方麵取得係統性研究成果，為(wei) 豬功能基因組與(yu) 育種研究增添了新利器。

我院博士趙長誌、碩士劉海龍和肖天賀為(wei) 文章共同第一作者，趙書(shu) 紅教授、謝勝鬆副教授為(wei) 文章共同通訊作者，上述研究工作得到了轉基因生物新品種培育重大專(zhuan) 項、國家自然科學基金等項目資助。

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