(通訊員:孫巧然、張晶晶)近日,我院苗義(yi) 良教授領銜的動物克隆與(yu) 幹細胞研究團隊在EMBO Journal期刊上發表題為(wei) “Histone methyltransferases MLL2 and SETD1A/B play distinct roles in H3K4me3 deposition during the transition from totipotency to pluripotency”的研究論文,揭示了組蛋白甲基轉移酶MLL2和SETD1A/B在胚胎細胞由全能性向多能性轉變過程中對H3K4me3建立和胚胎發育的不同調控作用。
組蛋白H3第4位賴氨酸的三甲基化(H3K4me3)是真核生物中高度保守的表觀遺傳(chuan) 修飾之一,廣泛參與(yu) 細胞分化、發育及疾病發生等生物學過程。在哺乳動物中,H3K4me3由SET1/MLL複合體(ti) 催化建立,該複合體(ti) 包括多種H3K4甲基轉移酶(SETD1A、SETD1B、MLL1和MLL2)及多個(ge) 必要蛋白亞(ya) 基。盡管H3K4me3是活躍基因啟動子上的標誌性修飾,但其在基因表達調控中的功能仍未完全闡明,尤其是在哺乳動物早期胚胎中,H3K4me3的分布模式發生了顯著的重編程:在合子基因組激活(Zygotic Genome Activation, ZGA)之前呈現與(yu) 轉錄沉默相關(guan) 的非經典模式,而在ZGA期間轉變為(wei) 與(yu) 活躍基因啟動子相關(guan) 的經典模式。然而,這兩(liang) 種H3K4me3分布模式的形成機製及其調控功能仍不明確。
研究人員首先通過分析小鼠早期胚胎的轉錄組和翻譯組數據,確定了胚胎中主要表達H3K4甲基轉移酶MLL2和SETD1A。隨後,分別敲低Mll2和Setd1a/b(單獨敲低Setd1a會(hui) 引發Setd1b的代償(chang) 表達),並在ZGA前的早2細胞期、ZGA發生的晚2細胞期以及ZGA後的桑椹胚期檢測H3K4me3的富集變化。結果顯示,MLL2不僅(jin) 負責ZGA前非經典H3K4me3的建立,還參與(yu) ZGA期間經典H3K4me3的形成,而SETD1A/B則主要負責ZGA後經典H3K4me3的建立。此外,使用轉錄抑製劑短時處理晚2細胞胚胎和桑椹胚,結果顯示該處理顯著降低了ZGA後由SETD1A/B介導的H3K4me3建立,但對ZGA期間由MLL2介導的H3K4me3建立無影響。基於(yu) 此,研究人員將胚胎中H3K4me3分為(wei) 兩(liang) 種類型:MLL2催化的轉錄獨立型(Transcription-independent)H3K4me3和SETD1A/B催化的轉錄依賴型(Transcription-dependent)H3K4me3。
研究人員進一步探究了轉錄獨立型和轉錄依賴型H3K4me3在小鼠早期胚胎發育中的功能。首先,無論是敲低Mll2和過表達Kdm5b以降低早2細胞期的非經典H3K4me3富集,還是敲低Kdm5b和使用KDM5抑製劑來增加晚2細胞期的非經典H3K4me3富集,都不會(hui) 影響胚胎整體(ti) 的基因表達。此外,晚2細胞期經典H3K4me3富集的增加或減少對ZGA基因表達的影響微乎其微,這些結果表明MLL2催化的轉錄獨立型H3K4me3在胚胎全能性階段存在非指導性作用。然而,通過敲低Setd1a/b或使用KDM5抑製劑改變ZGA後胚胎的H3K4me3富集,這會(hui) 顯著影響決(jue) 定細胞命運譜係分化的關(guan) 鍵基因表達,並導致囊胚發育受損。因此,由SETD1A/B催化的轉錄依賴型H3K4me3在調控胚胎多能性建立和植入前囊胚形成過程中發揮了重要作用。
上述研究結果揭示了早期胚胎在從(cong) 細胞全能性向多能性轉變過程中,MLL2和SETD1A/B通過接力方式介導H3K4me3富集動態轉變的機製,這為(wei) 解析早期胚胎發育的表觀遺傳(chuan) 調控機製提供了新的科學依據。

圖 MLL2與(yu) SETD1A/B通過調控H3K4me3建立影響早期胚胎發育
星空体育网站入口官网苗義(yi) 良教授和劉鑫副研究員為(wei) 本文的共同通訊作者,博士生張晶晶和孫巧然為(wei) 共同第一作者。該研究獲得國家自然科學基金、國家重點研發計劃和中央高校基本科研專(zhuan) 項資金等項目的資助。
審核人:苗義(yi) 良
原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s44318-024-00329-5